Нет, не всегда удобнее. Они точнее. При работе с трекболлом задействуются совсем другие мышцы. Если мышку мы двигаем запястьем, то трекболл мы вращаем пальцами и задействуем мышцы мелкой моторики ладони. По стоимости же изготовления - текболлы на первых порах были дороже шариковых мышек, в основном из-за системы подвеса шара и самого шара (в мышке шар опирается не на ролики, а на стол).
С точки зрения физиологии, мышка чуть более эргономична, так как задействует для перемещения ровно ту группу мышц, которую мы используем при письме.