Скорее всего, из-за того, что они имеют сравнительно небольшой размер, следовательно мы не всегда можем заметить их появление, а это пугает. Например, даже, если я и боюсь собаку, я могу увидеть её из далека и принять какие-либо меры предосторожности. Плюс, осознание того, что некоторые насекомые могут оказаться ядовитими тоже не вселяет сильной любви. И да, многие люди боятся именно "внешнего вида" насекомых.