Я могу ответить, почему я сама бы не стала проходить курсы GeekBrains:
1) Я не знаю, кто их преподает. Я видела вакансии преподавателей этих курсов и они не очень привлекательны для хороших специалистов. Думаю, что там много таких же студентов. В то время как на Coursera я могу пройти курс от признанных профессионалов, например Седжвика или Эндрю Ына
2) Они стоят денег. Есть много бесплатных курсов, например Stepic или часть Coursera.
Если курса, который вы хотите пройти, нигде больше нет - то не волнуйтесь и записывайтесь, думаю, Mail.ru, который купил GeekBrains все-таки дает гарантию качества.
Я бы еще добавил 3 пункт.
3) Очень долго длится курс. Какой курс не глянь, то там за 6 месяцев сократить до 1 месяца.