Если я не ошибаюсь,то этимология данного термина берет свои корни из Библии (из книги Иова,если точнее),где бегемотом прозвали одно из чудищ,показанных Иову.Это слово является множественным числом от "бехема",что с иврита буквально переводится как "животное".
как-то так.