У этого явления есть факторы биологически обусловленные и социо-культурно.
Изначально это защитный биологический механизм, что мы считаем более симпатичным и безопасным для нас человека, который похож на нас (по цвету кожи, по глазам, волосам и другим пунктикам). Скорее всего такой человек причинит нам меньше вреда, чем представитель с более отличительными чертами. Это говорит нам наша древняя часть мозга.
Социо-культурный феномен исходит из того, что одни нации менее развиты, чем другие, но по куче разных факторов, а вовсе не потому что они от природы глупее и не способны к развитию или прогрессу. Например, многие африканские народы не находились в столь суровых условиях, чтобы им пришлось строить корабли и развиваться, как жителями суровых северных регионов. А потом одни народы начали ущемлять другие и сдерживать их развитие. А что сейчас? Из африканцев тоже выходят талантливые люди. Нетерпимость может развиваться из-за предрассудков и сознательно спровоцированных масс-медиа причин.