От латинского annihilatio – это уничтожение (ad – к, nihil – ничто). Но в действительности частицы при взаимодействии не просто исчезают (становятся ничем), а превращаются в иные частицы.
чаще в фотоны а при высоких энергиях в други частицы
В физике под термином "аннигиляция" понимают процесс столкновения частицы и античастицы, при котором появляются другие частицы, отличные от исходных.
В других областях это слово применяют в значении "полное уничтожение".
Аннигиля́ция (лат. annihilatio — уничтожение) — в физике реакция превращения частицы и античастицы при их столкновении в какие-либо иные частицы, отличные от исходных. (Источник: https://soosle.ru/vertinskaja/ )
Деконструкция частиц/элементов при их взаимодействии и последующая полная их "пересборка" заново в иные, отличные от исходных частицы/элементы. Вероятно эта "пересборка" необратима.