Коричневые подтёки - скорее всего - железо. В воде много железа и солей жёсткости. Удаляется чёрным "Туалетным утёнком" или аналогичным средством, содержащим соляную кислоту. Эффективно помогает только средство с соляной кислотой, проверено. Лимонная кислота, уксус и т.п. не помогают.
Использовать средства, содержащие соляную кислоту, нужно с соблюдением всех мер предосторожности: в прочных перчатках из резины, ПВХ или аналогичных материалов, а также, при попадании средства на кожу, сразу промыть большим количеством воды с содой.