Может быть Вы подхватили вирус, который скрывает файлы? Попробуйте зайти в панель управления->параметры папок->вид->Скрытые файлы и папки - выбрать пункт показывать скрытые файлы, скрывать защищенные системные файлы - убрать галочку.