Да)но скорее не на гражданство(хотя хрен знает) а сначала на вид на жительство по происхождению. я не могу ответить 100% по вашей ситуации, так как моя немного отличается. у моего папы эстонские корни, что-то типо (пра)прадедушки, он эстонец на 1/6+открыл малый бизнес в Эсти. ему дали краткосрочный вид на жительство, сейчас дали долговременный , на 10 лет. У вас дедушка-эстонец это лучше, он близкий родственник. так что смело подавайте, думаю даже на гражданство можно. если даже сейчас не одобрят гражданство, вид на жительство получите без труда.
еще один факт, на сайте консульства эстонии по-моему нигде не написано про такую причину получения гражданства/ВНЖ как родство крови, но! она есть, про нее умалчивают(не знаю почему), так что все вопросы задавайте лично в консульстве/посольстве, на сайте вы не найдете инфу про эту(или найдете но мало.)
Надеюсь вам дадут гражданство)) удачи!