Сам являюсь студентом бакалавриата НИУ ВШЭ, но немного разбираюсь в системе образования и могу передать мысли преподавателей-практиков, которые отлично разбираются во всем, что касается взаимосвязей "учеба — работа".
Итак, в России действительно есть проблема с высшим образованием в области управления. Из сильных вузов в этой области могу назвать два: факультет бизнеса и менеджмента НИУ ВШЭ и высшая школа менеджмента СПбГУ.
Что касается управления проектами в НИУ ВШЭ: курируют это направление очень квалифицированные и строгие преподаватели, действительно мастера своего дела. Наверное, это самое сложное направление обучения на факультете. Мой совет: свяжитесь с академическим руководителем образовательной программы, попробуйте назначить встречу. Я думаю, он с радостью ответит на все ваши вопросы.
Что касается магистратуры или MBA, здесь идёт разница в целях обучения. Изначально, Болонская система образования (к которой так активно стремится НИУ ВШЭ) подразумевает, что магистратура для тех, кто более склонен к научной деятельности: она как переходный этап между бакалавриатом и аспирантурой. MBA более для практиков, которые точно знают, что им нужно от образования и как это применять на их работе. Стоит отметить, что в магистратуру или MBA вообще не стоит идти, если вы не проработали в этой области достаточное количество времени и не ощутили "потолка развития", из-за отсутствия образования.
В любом случае, желаю Вам удачи в карьере и образовании, надеюсь, Вы найдёте то, что ищете.