Смотря какую задачу ставит перед собой компания. Если задача глубоко инженерная, то обширное описание даст система нотаций ARIS, если необходимо просто описать процессы с целью оптимизации, то понятнее для обыватеельского глаза станет описание процессов в нотации BPMN 2.0. Можете воспользоваться специальными ресурсами или использовать обычные mind map's соблюдая метод нотаций.