Какой паспорт указывать в пассажирской таможенной декларации?

Если вы находитесь в пункте пропуска через государственную границу, то тот по которому будете ее пересекать.

Если вы проводите таможенное оформление на "внутреннем" таможенном посту груза, следующего отдельно от Вас, то общегражданский