На примере своих друзей-предпринимателей, могу с уверенностью ответить, это - Москва. В течении этого года, они все перерегистрировали свои ИП, ООО и т. д. из мест постоянной регистрации и проживания в столицу, где самый благоприятный бизнес-климат в РФ.
Очень интересный вопрос. В любом городе миллионнике вас примут с распростертыми объятиями. А лучше выбирать не город, а прибыльную нишу, прибыльный продукт. Можно рассмотреть не только бизнес проекты, но и ценные бумаги, акции.