Основой фамилии послужило имя Иса, которое в Коране было дано Иисусу Христу.
Есть и другие версии.
Фамилия произошла от церковного имени Исайя, имеющего древнееврейские корни, а точнее - от его разговорной формы Исай. Означает оно "спасение Господне".
или
Фамилия связана с иным древнееврейским именем Исаакий - "смеющийся".