Не наиболее, но философским я бы назвал "Железобетон" (Tekkon kinkurîto) 2006г. Это смесь быта, города, сопротивления и самопознания подрастающего ума.
И, конечно же, Ночь на галактической железной дороге 1985г. Смесь христианских и буддистских мотивов, идеи о смерти и смысле жизни, выливающихся в мультфильм, будто экранизирующий чей-то сон.