Каким образом используется квантовая запутанность в квантовом компьютере?

Она не используется, а просто есть. Преимущество квантовых компьютеров в параллельной обработке всех возможных состояний набора кубитов. Эти состояния находятся в суперпозиции - итоговое состояние является запутанным.