Самые затратные части, про которые даже и не подумаешь:
Внутренняя отделка (каменные дома очень дорого отделывать, потребуется тонны штукатурки, шпатлевки, грунтовки, цемента для вырвнивания потолков, долбить стены для прокладывания проводки и многое другое).
Электрика и сантехника
Отопительная система
Расчитать довольно точно можно:
Стоимость фундамента (складываете стоимость: копания траншей под фундамент, цена за определенное колличество бетона, работа рабочих)
Коробка дома
Крыша
Окна
как посчитать п.2 и 3? хотя бы примерно. пусть с погрешностью в десятки тысяч