Патент может применяться только в паре с базовой (основной) системой налогообложения - УСН или ОСНО.
Учитывая то, что Патент выдаётся только на определенный(ые) вид(ы) деятельности - все доходы полученные "мимо" патента подлежат декларированию по базовой системе налогообложения.