Никогда не испытывал дискомфорта, когда кто называл меня по фамилии. Однажды девушка, бывшая, правда, на 3 неделю отношения призналась что не помнит моего имени. Забавно было. Не видел никогда смысла стыдится своей фамилии. Хотя я не знаю какая у вас ситуация в семье, так что не мне судить. Мне кажется, вас раздражает, скорее пренебрежительная интонация.
Не отвечать на обращения по фамилии, попросту подчеркнуто игнорить. Повторять сдержанно, что имеете имя, и предпочитаете, чтобы назвали именно по нему
Я поступал так.