Атом никак не выглядит, понятие форм, цветов и размеров не верны для микрообьектов, так как длина видимого света явно меньше самих обьектов. Но все же получить "изображение" возможно, например с помощью мощных электронных микроскопов, использующих вместо фотонов электроны. Доказательств современной модели атома очень много, все начиналось с экспериментов, например эксперименты в которых происходил распад ядер и т.д.