Анна, налогом самозанятого гражданина облагаются только те платежи по которым сформирован чек.
В случае выбора автоматического формирования чека по всем поступлениям на определенную карту, все поступления будут облагаться налогом. Поэтому лучше открыть другую карту ,либо цифровую с дистанционным обслуживанием-данный сервис предлагает "зеленый банк".
В приложении "Мой налог" можно привязать несколько карт, по которым ваши клиенты будут производить оплату.