Скриншот информации веб-сервиса Google для проверки скорости загрузки веб-сайта PageSpeed Insights: https://yadi.sk/i/9RvDeJgsVOtwMw
То, что счётчик нужно разместить в голове сайта-это рекомендация, но не обязательно... Рекомендуют размещать в голове сайта для того, что бы если клиент зашёл на сайт, а страница не успела полностью загрузиться, то и счётчик не загрузится (если он размещен например в подвале сайта) ... Значит посещение не будет учтено... Ну или в подвале есть другие скрипты которые долго грузятся, а счётчик не успеет загрузится, а пользователь в это время уже что то посмотрел, покликал по кнопкам например...
По вопросу: у скрипта счётчика есть атрибут src, в нем указан адрес скрипта... Нужно открыть эту ссылку и скопировать код.... Создать локально (на сайте, на хостинге) новый файл с этим кодом или добавить к существующему файлу скриптов. Что бы в конечном итоге этот файл с кодом счётчика попал в общий кеш... Если коротко, то разместить этот код не на стороне Яндекса, а локально.... НО!!!! Если Яндекс обновит код, то его тем же методом нужно обновить и локально...
Согласно инструкции к сервису Яндекс.Метрика, для корректной работы код счётчика должен быть установлен в разделе <head>...
Вариант - через асинхронный код. О том, что это такое вы можете прочитать, например, здесь: https://developer.mozilla.org/ru/docs/Learn/JavaScript/Asynchronous/Introducing