Если вы администратор сайта и имеете доступ к хостингу , на котором этот сайт расположен, то удаляете его через личный кабинет (хостинг - это, простым языком, место, где "лежит" сайт в интернете). На разных ресурсах по разному, но всё равно кнопка "отказаться от дальнейшего обслуживания" где то есть. Резервная копия в архиве при этом всё равно какое то время хранится. Бывает, что и годами (из личного опыта).
Если вы администратор сайта но не имеете доступа к хостингу, то материалы сайта можно удалить через админку самого сайта , при её наличии. При этом сам движок скорее всего не удалить. Но оставить одну страницу "homepage" , пустую, без единой строчки кода, вполне возможно. Ну, или с каким то минимумом.
Если вы не и меете доступа ни к админке хостинга ни к админке сайта - то удалить его с ресурса не сможете.
А вообще, человек, который знаком с разработкой сайтов хотя бы на базовом, школьном уровне, такой вопрос, скорее всего не задал бы.
Ну, как вариант, добавлю, что на сайт можно пожаловаться, и не обязательно в Роскомнадзор. Можно и администраторам того хостинг-провайдера, где сайт лежит. Сказать, например, что есть картинки, нарушающие авторские прова. Доказательства привести. Тогда сайт после проверки заблокируют. Два раза сталкивался по работе с этим.