Как сказать девушке, что мне нравится когда она не использует макияж, но при этом не обидеть ее?

Вспомнить о том, что это девушка, ей нужно больше, чем просто констатация факта.

Например, сказать, когда она будет не накрашена: "Я не понимаю, зачем такой красивой девушке вообще нужна косметика" или "Когда я впервые увидел тебя без макияжа, ты понравилась мне даже ещё больше, чем с ним", или "Ни одна накрашенная девушка не идёт в сравнение с твоей естественной красотой". В таком духе. Схема проста-делаешь комплимент, доказывая как она невероятно прекрасна без макияжа, но не говорить напрямую о том, что краситься ей не надо. Подаёшь это красиво и в нужный момент (не единожды,а периодически)-и она сама со временем перестанет наносить макияж.

И да, ни в коем случае и ни при каких обстоятельствах не говорить, что ей просто не идёт макияж, или что она не умеет его делать. Последствия могут быть катастрофичными.