Если кратко, то формирование так называемых окаменелостей происходит двумя путями:
Заполнение объема, занимаемого останками организма, горными породами.
Замещение тканей организма неорганическими соединениями в результате химических реакций.
Спасибо Евгений вам за ответ. Интересно, а сколько это по времени занимает?