В зависимости от того, кто его играет. Если МакЭвой- то Хавьер, если сэр Маккелен- то Ксавьер. Шутка:)
На мой взгляд именно как Ксавьер- не знаю насчет фонетики английского языка, но знаю точно, что в фамилию Профессора Икс вкладывали как его персональное геройское имя, так и название контролируемого им отряда.
Если имя французкое, то транслэйт утверждает что кзавье