Футбольный клуб «Амкар» был создан как команда пермского ОАО «Минеральные удобрения». Официальной датой рождения считается 8 мая 1993 года. Название «Амкар» происходит от сочетания частей слов аммиак и карбамид — эти два вещества являлись главной продукцией предприятия.