Когда возникает такая необходимость приглашается кризис-менеджер или антикризисный управляющий.
Из личного опыта, важный момент — кто заказывает аудит — финансовый, технологический и др. То есть — кто формирует вопросы к аудиту — владелец или приглашенный спец.
К сожалению, владельцы бизнеса, как правило, тянут до последнего — когда что-то исправить очень сложно.