Это несложный вопрос. Сейчас создано множество сортов яблонь, груш, устойчивых к парше или даже вообще ко всем болезням. То есть такие плодовые не надо будет обрабатывать химией. Их и надо покупать для высадки в своем саду.
Нужно создать идеальные для каждого плодового дерева условия (температуру, влажность, полив, удаление нежелательных соседей, обрезка и формирование дерева) и поддерживать их. Можно использовать естественную экологичную подкормку.