Как лекарство попадает туда, куда нужно?

Есть такой раздел фармакологии - фармакодинамика. Он как раз об этом.

Существует понятие "тропность", то есть сродство. Если бы лекарство равномерно распределялось по всему организму (как предложили в предыдущем ответе), нужны были бы очень большие дозы и токсический эффект наступал бы раньше терапевтического.

Большая часть поступившего лекарства распределяется неравномерно. И зависит это от многих факторов: от способности/неспособности растворяться в воде и липидах, от того насколько лекарство связывается с белками (рецепторами), от наличия и способности проходить через различные барьеры (таким барьером, например, является плацента при беременности), от особенностей кровотока.

Если при создании нового лекарства всё это учесть, оно попадёт куда нужно.