Лучший вариант - устранение причины ее появления. Возможными причинами могут быть: переизбыток органики, освещения, перенаселенность аквариума.
Один из способов, избавиться от черной бороды - сайдекс (раствор глутарового альдегида, предназначенный для дезинфекции и холодной стерилизации медицинских инструментов и оборудования).
Дозировка: 20мл на 100 литров аквариумной воды (рыбки и живые растения от этого не постродают), а черная борода исчезнет.