Известно ли о случаях, когда волшебники получали письмо из Хогвартса, но не принимали приглашение учиться, потому что хотели остаться в обычной школе с друзьями-маглами?

Скорее всего, с такими семьями проводили беседы уже работники школы либо министерства. Потому что, как уже отметили в другом ответе, со временем магию становится все сложнее контролировать, и такой человек будет опасен уже не только для своей семьи и себя. Вряд ли кому-то хотелось через 10-15 лет получить очередного пациента больницы св. Мунго.