Судя по книге Петра Авена, из-за сюжета Доренко о "Курске", а также из-за открытого письма Путину, в котором Березовский называл его на "ты". Первое Путин воспринял как удар в спину, второе - как наглость зарвавшегося финансового мешка, не пожелавшего знать свое место.