Является ли такой профессиональный участник рынка ценных бумаг как реестродержатель (регистратор) налоговым агентом?

По поручению эмитента регистратор может выступать налоговым агентом.

Если у вас, как у инвестора возник налоговый случай (не важно по какой причине), регистратор здесь не при чем. Все определено в вашем взаимоотношении с брокером. Обычно он является налоговым агентом.

Регистратор осуществляет сбор, хранение и передачу документов и информации о лицевых счетах. Прочитайте подробнее о функциях и обязанностях регистратора здесь.