Фреймы это набор независимых окон, поэтому для того, чтобы ссылка открывалась в нужном месте, обязательно указываем имена фреймов.
Для этого надо прописать target="CONTENT" где CONTENT — название области, где будет выводиться. Если атрибут ссылки target="CONTENT" будет опущен, документ откроется в текущем фрейме, где находится сама ссылка.
Чтобы одновременно обновить сразу два фрейма и загрузить в них разные документы, придется воспользоваться JavaScript.
Более подробно можно прочитать тут.
Смысл не атом что бы открыть ссылку во вфрейме, а в том что бы сам фрейм сделать кликабельным.