Если сложить теорию мультивселенных и Бога,то в каждой вселенной будет разный Бог, или во всех один и тот-же?

Не стоит мешать мух с котлетами, если вы говорите о естественно-научной теории мультивселенной (хотя правильнее было бы называть ее гипотезой). Она была выведена как раз для того, чтобы избавиться от проблемы так называемой "тонкой настройки вселенной", не привлекая при этом концепцию Бога, как разумного создателя.

Тонкая настройка Вселенной — концепция в теоретической физике, согласно которой в основе Вселенной и ряда её составляющих лежат не произвольные, а строго определённые значения фундаментальных констант, входящих в физические законы. Причем, отличие этих констант от тех значений, которые мы можем зафиксировать в нашей Вселенной, привело бы к невозможности эволюции и существования этой самой Вселенной.

Теологи считают строгую определенность фундаментальных констант результатом разумного замысла. Физики предлагают ряд гипотез, которые в большинстве своем являются экспериментально непроверяемыми и нефальсифицируемыми (как и идея Бога), в которых объясняют это существованием N-ного (или бесконечного) количества других Вселенных с другими значениями констант, в которых атомы, звезды, планеты и, соответственно, жизнь не могли возникнуть. 

Если же смотреть на вопрос с точки зрения религии, то упоминание множества миров в той или иной форме существует в большом количестве религиозных течений индуизма, буддизма, ислама, иудаизма, мормонизма и других. В зависимости от религии количество богов постулируется разное. Но, конечно, к научной гипотезе мультивселенной это не относится.