Они могут отличаться морфологически - иметь разную протяжённость и форму отростков, образовывать разное количество контактов, которые в свою очередь, также отличаются морфологически (аксо-дендритические — с дендритами, в том числе аксо-шипиковые — с дендритными шипиками; аксо-аксональные — между парой аксонов; аксо-соматические — между аксоном и телом нейрона; дендро-дендритические — между дендритами).
Кроме того, нейроны различаются по секретируемым нейротрансмиттерам (существуют медиаторы и модуляторы, и здесь немало тонкостей).
В ходе онтогенеза одни контакты сменяются другими, меняется биохимия, вплоть до того, что один и тот же медиатор может инициировать реакцию, результат которой будет диаметрально противоположен тому, что наблюдался в молодом мозге.
Мозг - очень замысловатая система. )