Используя VK api можно написать скрипт, например на python. Там есть есть функции которые восстанавливают сообщения. Писал эту программку когда то:)
В API ВКонтакте такая возможность вроде бы отсутствует, соответственно, нет, восстановить удалившиеся сообщения нельзя. Однако если у вас были настроены оповещения на почту, сообщения можно найти там (но, само собой, только входящие).