Доказано ли существование свободной воли? Или же выбор человека обусловлен исключительно строением его организма и воздействующей на него средой? И что в действительности означает слово "сам"?

Нет и не может быть свободной воли у человека. Во первых в физическом мире он зависим от Закона греха и смерти, если сделается переход в другую сферу жизни, то есть после физической смерти, человек зависим от непрерывного источника Жизни, чтобы быть бессмертным. Поэтому чтобы проявить независимость, или свободу своей воли ему надо избавиться от этих факторов влияния на него.