Перекидывать файлы по Bluetooth. Сейчас это, возможно, уже не так актуально, но мелкие файлы порой удобно по-быстрому отправить по Bluetooth, а не отправлять их по e-mail, загружать в облако и т.п. Тем более, это выручает при отсутствии Интернета;
Заменять стандартные приложения. В Android вы можете поставить любой будильник, скачанный из Google Play (либо из другого магазина приложений или в формате APK откуда угодно), и если вы его заведёте, он будет полностью работать как обычный, системный будильник (то есть, скажем, громкость будильника, установленная в настройках, будет применяться к этому приложению, будильник зазвонит независимо от того, открыто будет приложение или нет) — в iOS системный будильник работает как будильник, а чтобы использовать сторонние приложения в этом качестве, нужны какие-то ухищрения. То же самое с браузером: в Android вы можете поставить любой браузер (Opera, Google Chrome, Dolphin и т.д.), и если вам нужно, им можно заменить системный браузер — в итоге все ссылки откуда угодно будут открываться выбранным вами браузером — в iOS же можно поставить сторонний браузер, но ссылки по-прежнему будет открывать Safari. Та же ситуация с электронной почтой, отправкой SMS и даже меню (в Android даже можно установить приложение, которое заменит вам меню, и меню вашего телефона будет выглядеть по-другому), даже клавиатурой (в Android можно заменить стандартную клавиатуру на любую другую — речь не только о языке, но и о размере, цвете клавиш, способе ввода и т.д. и т.п.);
Синхронизировать в фоновом режиме. По моему опыту iOS не загружает в облако файлы в фоновом режиме, то есть, скажем, чтобы вам загрузить сделанные с телефона фото в облако в iOS (и облако не iCloud), нужно открыть приложение облака. В Android облачное приложение может работать и в фоновом режиме, и файлы будут загружаться, даже если приложение закрыто;
Выполнять задания по расписанию. Для Android есть приложения, которые, например, отправляют SMS в заданное время (к примеру, нужно кого-то поздравить, а вы можете забыть — пишете SMS сейчас и выбираете время отправки) — для iOS ничего такого нет;
Давать общий доступ к файловой системе. Этот ответ уже дан Александром, и в целом всё верно: в Android вы можете с помощью файловых менеджеров взаимодействовать с файловой системой непосредственно, копируя, перемещая, удаляя, редактируя файлы, создавая и выполняя все прочие операции с папками, работая с архивами — в iOS, по крайней мере, в полном объёме такая возможность не предоставляется. Можно в некоторых случаях открыть один и тот же файл в разных приложениях — например, если он получен по почте, то там будет выбор вариантов, как его открыть; можно отправить полученный файл каким-то другим способом по Интернету; в ряде случаев можно редактировать и сохранять изображения — но весь этот функционал по сравнению с Android достаточно ограничен, из-за чего на iOS, к примеру, сложно представить приложения-словари, куда вы сами закачиваете словарные базы (как Fora Dictionary на Android, например), навигаторы, куда вы закачиваете карты (как OsmAnd, например), но и мороки у вас меньше, правда. Заодно добавлю, что все Android-устройства, которые я встречал, работают с картами памяти — вы можете быстро передать большой файл с одного устройства на другое, просто вынув карту из одного и вставив в другое, потом скопировав файл во внутреннюю память устройства-получателя — в iOS-устройствах же встроенных кардридеров, как и возможностей удобно работать с картами памяти из-за отсутствия открытой файловой системы нет;
Настраивать виджеты/ярлыки быстрого запуска. Например, если вы для экономии заряда батареи/трафика часто выключаете и включаете передачу данных (мобильный Интернет), в Android для этого можно установить/настроить виджет, либо воспользоваться, например, выпадающим меню (типа того, что есть в приложении Bar Shortcuts), чтобы не заходить каждый раз в Настройки. В iOS придётся заходить в Настройки. То же самое с приложениями, которые вы часто запускаете — в Android вы их можете «повесить» на главный экран, в iOS они открываются только через меню. Кроме того, в Android вы можете специально выводить на главный экран информацию из какого-либо приложения (скажем, прогноз погоды) — в iOS тоже есть такого рода информирование в выпадающей сверху ленте, но оно системное, и выбрать «поставщика» информации для этой ленты не получится;
Проигрывать FM-радио. Это ограничение, скорее, связано не с iOS, а с устройствами, на которых она устанавливается, но, в общем, в iOS нет FM-радио, а в Android обычно есть.
Я пользовался Андроидом долгое время, сейчас пользуюсь Айфоном и планшетом на Android. Не могу сказать, что iOS сильно уступает Android по удобству и по спектру тех задач, которые может решать смартфон: да, в iOS есть ряд ограничений, но они всё же ударяют не по жизненно важным функциям, а по некоторым «особенностям» на любителя — взамен имеющейся в Android некоторой свободы Apple предоставляет отличный готовый интерфейс, полноценные и быстрые системные приложения, гибкую систему настроек — то есть в итоге в iOS есть определённый набор хорошо работающих вещей, и многим людям этого достаточно — и им незачем искать какие-то альтернативы, что-то с чем-то сравнивать, как они бы делали в Android. Apple им в свою очередь гарантирует нормальную работу программного обеспечения (Google же этого в полной мере сделать не может из-за того, что пользователь может доустановить 100500 программ, влияющих на работу системы). Так что тут нельзя сказать, что лучше или хуже — это просто 2 разных подхода, и каждый решает для себя сам.