Это исключительно внутрирелигиозная дисциплина, направленная на изучение течений, отколовшихся от рассматриваемой религиозной организации, например, от РПЦ. В России, в виду деятельности православного сектоборца Александра Двокрина, сектоведение утратило своё значение, так как Дворкин стал называть сектами вообще все неправославные организации, в том числе общественные и даже коммерческие. С его подачи термин "секта" и новояз "тоталитарная секта" были превращены в клеймо и по сей день используются для очернения любой неугодной организации. По причиной такой мутации дисциплины в Православном Свято-Тихоновском гуманитарном университете в 2012 году кафедра сектоведения, которую возглавлял Дворкин, была упразднена, а с сайта синодального миссионерского отдела РПЦ была удалена информация о том, что в 1993 году при отделе Дворкиным был учрежден сектоведческий Центр Св. Иринея Лионского. Тем не менее, в России есть специалисты по классическому церковному сектоведнию, которые занимаются изучением отколовшихся от РПЦ течений и апологетикой. Один из таких специалистов Роман Конь.