Что такое религия: наличие веры в Бога или определенная система верований? Являются ли пастафарианство и атеизм религиями?

Религия это некие отношения со сверхъестественным оформленные в традиции, обряды, культы, нормы взаимоотношений.

Поэтому пастафарианство это религия, но религия шуточная.

А атеизм -- религия только тогда, когда она принимает форму подобную той, что была в СССР во времена "Союза воинствующих безбожников" (есть статья в вики). 

Пока атеизм просто система взглядов отрицающая существование сверхъестественного это просто философия. 

Но когда это принимало формы особых отрицающих взаимоотношений с Богом, когда этому посвящалась вся жизнь, когда просто вид всего, что связано с Богом вызывал буйство, когда пропаганда подразумевает не просто философию, а именно личное отношение как к чему-то существующему, пусть и якобы не всерьез, то это уже религия или квазирелигия.

По воспоминаниям комсомольцев 20-ых годов из моей семьи -- демонстрации с ряженными чертями, попами и прочими с криками "залезем мы на небо, разгоним всех богов" -- здесь были и обряды, и традиции, и культ, и нормы более жесткие, чем среди верующих того же времени. Не было формально только сверхъестественного, хотя в формулах ругательств оно было -- не очистим наши умы от богов, а "залезем на небо" и прочие всякие действия совершим с вашими богами.