Здесь (как и в большинстве других случаев) совершенно нет необходимости "рассуждать" или "предполагать". Потому что есть Уголовно-исполнительный кодекс РФ и предписанные им для этих случаев статьи, а также их толкование юристами: вот, вот и вот.
Давайте смотреть как это происходит на самом деле:
1. ЧП непосредственно на самом Объекте, где находятся заключенные.
Пример: Всю ночь с 10 на 11 февраля бушевал огонь в здании УВД Самарской области. По предварительным данным... Читать далее
Всё зависит от сотрудников и начальства тюрьмы. Они могут оставить некоторых прямо в тюрьме. Скорее всего все будут заботится о жизнях мирных граждан, а потом уже о заключённых.