История этого фразеологизма начинается с гражданской войны в Испании 1936-39 годов. Так при подступе к Мадриду командующий силами франкистов заявил в обращении к жителям города, что помимо четырех колонн в его армии у него есть еще и пятая колонна в самом городе, которая ударит с тыла. Таким образом "пятая колонна" означает внутреннего врага, предателя.
Этот термин часто используется в современной России по отношению к людям не согласным с политикой действующего руководство страны.
Это выражение обозначает внутреннего врага, противодействующего подрывным образом, тех, кто действует тайно, предательски, выжидая удобный момент для открытого выступления.