"Безопасное извлечение" гарантирует, что операционная система завершит все операции записи до того, как вы вытащите флешку. Если пренебречь этим правилом, то можно потерять данные, которые вы копировали на флешку перед этим. Если же вам очень "повезет", то может пострадать служебная информация о том, где и какие файлы лежат на флешке, и придется "лечить" флешку специальными утилитами.