В эндоскопии (а оба исследования – это разновидности эндоскопии) нет понятия «процедура хуже» или «процедура лучше». Ощущения зависят от степени переносимости того или иного вмешательства в организм. Ведь кто-то плохо переносит даже осмотр горла ЛОР-врачом, когда он нажимает шпателем на корень языка.
По сути, переносимость обеих процедур зависит от опыта и навыков специалиста, который их выполняет, а также от того, как врач-эндоскопист произведет местную анестезию. В последние 10-15 лет эндоскопию (практически все ее виды, в т.ч. гастроскопию, колоноскопию, бронхоскопию) выполняют под наркозом, то есть во сне. Так что с ощущениями все вопросы решены.
У вас, может быть, и под общим наркозом. В городах поменьше - всё те же пятнадцать лет назад.
Переносимость индивидуальная. Обе процедуры достаточно неприятные. Но при хорошем оборудовании они переносятся достаточно хорошо, зависит от болезней, целей процедур.