Этимологию сложно установить, потому что это сленг. К тому же тюремный. Но, судя по всему, произошло от слова "шкварить". Почти все из значений этого слова связаны с усиленной термической обработкой, так что можно предположить связь с клеймением, то есть с выжиганием знаков на коже.