Следственный комитет относится к одной из трех ветвей власти, а именно "Исполнительная". Основная функция - расследование уголовных дел.
Прокуратура это надзорный оган и она не относится ни к одной ветви власти. Основная функция прокуратуры - надзор за соблюдение законов в стране.