Размером и мощностью. Всё зависит от обрабатываемой поверхности или детали. Ну и на большой реже менять диск придётся, т.к. он больше по размерам (ПРи одинаковых условиях работы). Маленькой можно подлезть в те места, куда большая не доберётся. А так, правильный вопрос заключает в себе половину ответа.