Попробуйте Cubase или Sound Forge (последний - заметно хуже). В них даже без плагинов можно получить выход отличного качества. Если речь идёт о Mac - без сомнения, только Logic X.
Вышеупомянутая Audacity в большинстве случаев подойдет. Там есть куча плагинов, включая шумоподавление, различные звуковые эффекты и т. д. и т. п.